Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms