Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms