Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms