Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnot2Q8C5L3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnot2Q8C5L3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms