Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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