Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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