Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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