Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms