Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edc4Q3UJB9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms