Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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