Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cst10-203ENSMUST00000109939 606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 1700017D01Rik-201ENSMUST00000025635 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2uos-201ENSMUST00000142634 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms