Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms