Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Top1Q04750 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms