Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GscQ02591 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GscQ02591 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms