Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlh1Q02576 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms