Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms