Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoa1Q00623 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms