Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms