Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Polr1bP70700 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Polr1bP70700 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Polr1bP70700 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Polr1bP70700 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Polr1bP70700 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Polr1bP70700 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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