Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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