Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms