Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms