Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vbp1P61759 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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