Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp1P55194 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp1P55194 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms