Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbrP50284 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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