Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CitP49025 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CitP49025 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CitP49025 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms