Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms