Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms