Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms