Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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