Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms