Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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