Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NapbP28663 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms