Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms