Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms