Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cldn10-201ENSMUST00000047761 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms