Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms