Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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