Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3002E9PW72 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3002E9PW72 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms