Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms