Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms