Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms