Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Plcb2A3KGF7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Plcb2A3KGF7 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms