Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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