Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Speer3W4VSP1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Speer3W4VSP1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms