Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28036V9GXJ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28036V9GXJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms