Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm17190V9GX38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17190V9GX38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm17190V9GX38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Gm17190V9GX38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm17190V9GX38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm17190V9GX38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17190V9GX38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms