Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms