Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hdac6Q9Z2V5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac6Q9Z2V5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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