Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crlf3Q9Z2L7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crlf3Q9Z2L7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms